במקור התמחה פרופ' הררי בהיסטוריה עולמית, היסטוריה של ימי הביניים והיסטוריה צבאית. מחקריו הנוכחיים מתמקדים בשאלות מאקרו-היסטוריות כגון: מהו היחס בין ביולוגיה להיסטוריה? מהו ההבדל המהותי בין האדם ליתר בעלי החיים? האם יש צדק בהיסטוריה? האם יש להיסטוריה כיוון? האם אנו מאושרים יותר כיום מאשר בעבר? אילו שאלות אתיות עולות מן המדע והטכנולוגיה במאה ה-21?פרופ' הררי הוא מחברם של הספרים "קיצור תולדות האנושות", "ההיסטוריה של המחר", "21 מחשבות על המאה ה-21" וכן סדרת ספרי הילדים ״היצורים שלא עוצרים״. נוסף על כך שותף הררי ליצירת סדרת הקומיקס "תולדות האנושות - היסטוריה מאויירת".
בשנת 2019, יסד יחד עם איציק יהב את Sapienship: חברת סושיאל אימפקט עם פרויקטים בתחום המדיה והחינוך, שמטרתה למקד את הדיון הציבורי באתגרים החשובים העומדים בפני האנושות כיום.